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Education
Laboratorio di Bioinformatica

Docente: Antoniotti

Crediti: 4 cfu

OBIETTIVI FORMATIVI

Il corso presenta metodologie computazionali classiche di analisi ed elaborazione di dati  biologici mediante l’utilizzo di strumenti software

Conoscenze (sapere)

Lo studente deve innanzitutto acquisire conoscenze di base sulle metodologie classiche di analisi ed elaborazione dei dati biologici. Quindi deve conoscere gli strumenti software oggi maggiormente utilizzati nell’ambito delle analisi dei dati biologici (analisi di sequenze, analisi di dati di espressione genica, etc..). Deve saper impostare un lavoro di analisi di dati prodotti da sperimentazione (in vivo o in vitro) biologica. 

Capacità (saper fare)

Lo studente acquisisce la capacità  di elaborare una metodologia di analisi di dati biologici effettuando prove pratiche in laboratorio relative a situazione classiche che il bioinformatico affronta.

PROGRAMMA DEL CORSO : 

  • Il dato biologico (banche dati genomiche,  software di analisi dati, dati di espressione genica da microarray)  In particolare: i Browsers Genomici: EnsEMBL, Genome Browser, Predizione di geni:Gensan, Genomescan
  • Introduzione al linguaggio Perl e utilizzo per l’analisi di dati biologici.
  • Applicazione di metodologie di clusterizzazione dati
  • Esercitazioni di laboratorio: Analisi della struttura di un gene mediante confronto con il trascritto,  Verifica dell´espressione di un gene mediante la banca dati EST. Mascheramento di regioni ripetute: RepeatMasker
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