Inizio della pagina -
Logo DISCO
|
Visita la Versione ad elevata leggibilità
|
Vai al Contenuto della pagina
|
Vai alla Fine dei contenuti
|
Vai al Menu Principale
|
Vai alla Barra di navigazione (sei in)
|
Vai al Menu di navigazione (albero)
|
Vai alla Lista dei comandi
|
Vai alla Lista degli approfondimenti
|
Vai al Menu inferiore
|
Logo Ateneo
   
Didattica
Bioinformatica

Docente: Bonizzoni

Crediti: 4 cfu 

OBIETTIVI FORMATIVI:

Il corso si propone di introdurre lo studente ad un recente settore di applicazione dell'Informatica noto come Bioinformatica: questa nuova disciplina è nata dalla crescente necessità nell'ambito della Biologia Molecolare di sviluppare adeguati strumenti computazionali per la soluzione di molteplici problemi, principalmente derivanti dall'analisi di sequenze biologiche (DNA, RNA).

 

L'obiettivo principale del corso è quello di fornire allo studente le conoscenze algoritmiche per poter affrontare la soluzione e lo studio di problemi classici di analisi e confronto di sequenze biologiche e di alberi evoluzionari.  

 

ABILITA’ SPECIFICHE:

saper progettare   la soluzione algoritmica di problemi di analisi di sequenze biologiche o di confronto e ricostruzione di alberi filogenetici

saper  modellare la soluzione di problemi biologici su sequenze genomiche mediante la formulazione di problemi combinatori

saper utilizzare le banche dati genomiche per estrarre le informazioni di interesse sul genoma umano

CONTENUTI:

Introduzione alla biologia computazionale: motivazioni e metodologie.

  1. L'importanza del confronto ed analisi di sequenze biologiche. Tecniche di allineamento multiplo di    sequenze (allineamento globale e  locale). Algoritmi per  l’allineamento di sequenze nella predizione della struttura di un gene (splicing alternativo). 
  2. La ricerca di motivi in sequenze biologiche.  Il problema generale del matching esatto. Gli alberi suffisso e la loro applicazione nella ricerca di ripetizioni nelle sequenze biologiche.
  3. Lo studio delle variazioni (mutazioni) geniche nella popolazione. Alberi evoluzionari. Ricostruzione della storia evolutiva di specie con alberi evoluzionari: metodi principali.  L'aplotipizzazione di individui: metodi combinatori basati sul modello coalescente e il criterio di massima parsimonia.
  4. Internet e il Progetto Genoma Umano. Le banche dati e il software per l’analisi del genoma.

    

Approfondimenti

Google Translate
Translate to English Translate to French Translate to German Translate to Spanish Translate to Chinese Translate to Portuguese Translate to Arabic
Translate to Albanian Translate to Bulgarian Translate to Croatian Translate to Czech Translate to Danish Translate to Dutch Translate to Finnish Translate to Greek Translate to Hindi
Translate to Hungarian Translate to Irish Translate to Japanese Translate to Korean Translate to Norwegian Translate to Polish Translate to Romanian Translate to Russian Translate to Serbian
Translate to Slovenian Translate to Swedish Translate to Thai Translate to Turkish

(C) Copyright 2016 - Dipartimento Informatica Sistemistica e Comunicazione - Viale Sarca, 336
20126 Milano - Edificio U14
redazioneweb@disco.unimib.it - ultimo aggiornamento di questa pagina 28/03/2011